Médecin des hôpitaux de Paris (1945), professeur agrégé (1946), médecin de l’hôpital Necker en 1949, puis professeur de clinique néphrologique, de 1958 à 1982, à la faculté de médecine de Paris (clinique néphrologique - hôpital Necker).
Directeur du groupe de recherche en néphrologie de l’Association Claude Bernard et de l’Institut national d’hygiène (INH) (1951-1964), puis de l’unité de recherche Inserm 25 sur le rein et l’immunologie des greffes (1964-1982).
Président de la commission scientifique spécialisée « Métabolismes inorganiques, physiologie et pathologie rénales et ostéo-articulaires » (1964-1967, 1968-1974).
Ardent défenseur de la culture scientifique française, Jean Hamburger fut l’initiateur et le fondateur de la revue franco-québécoise médecine/sciences, en 1985.

Sociétés savantes, académies
Président de la Société internationale de néphrologie (1960-1963) et de la Société internationale de transplantation (1968-1970).
Membre (1974) et président (1991-1992) de l’Académie des sciences - Institut de France
(1974), membre de l'Académie française (1985), membre de l’Académie nationale de médecine (1975).Docteur honoris causa des universités d'Athènes, Buenos Aires, Edimbourg, Genève et Lund, membre de diverses académies étrangères, Fellow du Royal College of Physicians.
Fondateur et vice-président de la Fondation pour la recherche médicale.
Président du conseil d’administration et du conseil scientifique du Palais de la Découverte.
Membre du Conseil de l’ordre de la Légion d’honneur et du Conseil de l’ordre des Arts et des Lettres.

Prix et distinctions
Lauréat de l'Académie des sciences (I967 et 1973), de la National Kidney Foundation de Washington (1973).
Commandeur de la Légion d'honneur, Grand-officier de l'Ordre national du mérite. Commandeur des Arts et des Lettres.
Divers prix littéraires dont le prix Fémina-Vacaresco (1972), le prix mondial Cino del Duca et le prix Balzac (1979).

Travaux scientifiques et médicaux
Les oeuvres et les travaux de Jean Hamburger ont concerné en particulier les maladies du rein et les transplantations. Il a été le créateur du concept de réanimation médicale (1953) et de la néphrologie, avec l’étude du rein normal et des maladies du rein. Réalisateur du premier rein artificiel français (1955). Premières greffes de rein réussies (premier succès prolongé en 1953, premiers succès définitifs entre faux jumeaux en 1959 et entre non-jumeaux en 1962). Recherches fondamentales sur l’immunologie des maladies rénales, l’immunologie de greffe et les maladies auto-immunes.
Avant de devenir un grand chercheur, Jean Hamburger fut un médecin exceptionnel, tout entier à l'écoute et au service des malades. La qualité de la médecine clinique dispensée dans le service de néphrologie de l'hôpital Necker – Enfants malades, qu'il a dirigé pendant 33 ans (1951-1982) a joué un rôle essentiel dans la réputation nationale et internationale de l'Institut du rein ouvert en 1970, où soins, recherches et enseignement ont été menés de front avec une rare complémentarité.
Jean Hamburger fut également un des premiers en France à apercevoir la chance inespérée que la biologie offrait à la médecine pour la faire sortir de sa pratique artisanale et empirique. Quel chemin parcouru depuis ces années 1950 où les premières greffes de rein étaient réalisées dans l'incrédulité générale. C'est dans une large mesure grâce à lui que la médecine et la recherche médicale françaises ont aujourd'hui la qualité qu'on leur reconnaît universellement. En témoigne son rôle dans la création de l’Association Claude Bernard, puis de l'Inserm en 1964 et de la Fondation pour la recherche médicale.
Par sa vue prophétique de l'évolution de la médecine, par la conviction de ses propos, par la réussite spectaculaire de ses recherches, Jean Hamburger a imposé un nouvel esprit à la médecine française, favorisant sa mutation vers une pratique médicale reposant sur des bases scientifiques solides et rigoureuses tout en gardant sa dimension humaine.

Auteur d’une série d’essais et d’œuvres littéraires consacrés à la réflexion d’un biologiste sur la condition humaine, sur les causes de la fragilité du monde actuel, sur la recherche d’un équilibre entre les impératifs biologiques et les exigences spirituelles de l’homme, et sur les limites et les “césures” de la connaissance.

Principales publications scientifiques
- Hamburger J, Richet G. The artificial kidney. Bull Acad Natl Med 141:12-25, 1957.
- Hamburger J. Electrolyte disturbances in acute uremia. Clin Chem 3:332-43.
- Hamburger J. Renal biopsy technic used at the Necker Hospital. Presse Med 66:1451, 1958.
- Hamburger J. Physiopathology of hypertension of renal origin. Pathol Biol (Paris) 7:1489-503, 1959.
- Hamburger J. Postoperative renal complications (Analysis of 200 cases). Presse Med 68:279-81, 1960.
- Hamburger J, Crosnier J. Medical reanimation. Problems presented by water-electrolyte balance and renal function. Helv Med Acta 27: 587-602, 1960.
- Hamburger J, Mery JP, Guerra L. Clinical study on the relation between the kidney and polyglobulia. Nouv Rev Fr Hematol 1: 503-18, 1961.
- Hamburger J. The classification of glomerulitis. Rev Fr Etud Clin Biol 6: 753-5, 1961.
- Hamburger J, Vaysse J, Crosnier J, Auvert J, Lalanne CM, Hopper J Jr. Renal homotransplantation in man after radiation of the recipient. Experience with six patients since 1959. Am J Med 32: 854-71, 1962.
- Hamburger J, Vaysse J, Crosnier J, Auvert J, Dormont J. Kidney homotransplantation in man. Ann N Y Acad Sci 99: 808-20, 1962.
- Hamburger J, Dormont J, Demontera H, Hinglais N. On an unusual familial malformation of the renal epithelium. Schweiz Med Wochenschr 94: 871-6, 1964.
- Hamburger J, Crosnier J, Dormont J. Observations in patients with a well-tolerated homotransplanted kidney: possibility of a new secondary disease. Ann N Y Acad Sci 120: 558-77, 1964.
- Hamburger J, Crosnier J, Dormont J. Experience with 45 renal homotransplantations in man. Lancet 1: 985-92, 1965.
- Hamburger J, Crosnier J, Dormont J. Renal human homotransplantation. A summary of personal research. Isr J Med Sci 3: 80-7, 1967.
- Hamburger J. Professor Hamburger on renal transplantation. JAMA 215: 494-5, 1971.
- Hamburger J, Dimitriu A, Bankir L, Debray-Sachs M, Auvert J. Collection of lymph from kidneys homotransplanted in man: cell transformation in vivo. Nature 232: 633-4, 1971.
- Hamburger J. Recent advances in the understanding of rejection. Adv Nephrol Necker Hosp 5:101-14, 1975.
- Hamburger J. Mechanisms of allograft rejection. Trans Am Soc Artif Intern Organs 22: 729-33, 1976.
- Debray-Sachs M, Liegeois A, Hamburger J. Presence of antigen-antibody complexes in antiallogeneic and antixenogeneic sera. Transplantation 22: 323-9, 1976.
- Hamburger J, Bach JF. Recent studies on graft immunology. Bull Mem Acad R Med Belg 132: 489-501, 1977.
- Hamburger J. Clinical transplantation. Transplant Proc 11: 1-3, 1979.
- Hamburger J. Prospects in transplantation. Ann Clin Res 13: 169-71, 1981.
- Hamburger J. The Jean Hamburger Symposium: The impact of immunology on nephrology and transplantation. - Closing remarks. Transplant Proc 14: 593-4, 1982.
- Dy M, Schneider E, Mavier P, Kamoun P, Lebel B, Hamburger J. Evidence for a lymphokine enhancing arginase activity during allograft rejection. J Immunol 130: 1937-42, 1983.
- Hamburger J. Insulin-dependent diabetes, an autoimmune disease. C R Acad Sci III 303: 299-301, 1986.
- Hamburger J. The beginning of kidney transplantation. Rev Prat 39: 1615-6, 1989.

Ouvrages de synthèse et de formation
L'oeuvre médicale et scientifique de Jean Hamburger s'est développée dans trois domaines qu'il a en fait lui-même contribué à créer : la réanimation médicale, la néphrologie et la greffe d'organes.
- Les migraines. Masson, Paris, 1935.
- Physiologie de l’innervation rénale. Masson, Paris, 1936.
- Petite encyclopédie médicale. Flammarion, Paris, 1942.
- Traité de pathologie médicale. 3 vol. Masson, Paris, 1948.
- Nouveaux procédés d’exploration fonctionnelle du rein. Masson, Paris, 1949.
- Métabolisme de l’eau. Flammarion-Médecine, Paris, 1952.
- Techniques de réanimation médicale. Flammarion-Médecine, Paris, 1954.
- L’insuffisance rénale. Springer Verlag, 1961.
- Conseils aux étudiants en médecine. Flammarion-Médecine, Paris, 1963.
- Traité de néphrologie. 2 vol. Flammarion-Médecine, Paris, 1966.
- La transplantation rénale. Flammarion-Médecine, Paris, 1968.
- Structure and function of the kidney (1971, Saunders),
- Dictionnaire de médecine, préface et direction. Flammarion-Médecine, Paris, 1975.
- Néphrologie. 2 vol. Flammarion-Médecine, Paris, 1979.
- Introduction au langage de la médecine. Flammarion-Médecine, Paris, 1982.

Ouvrages littéraires
Tous les ouvrages de Jean Hamburger laissent apparaître un esprit passionné par l'aventure humaine.
- La puissance et la fragilité. Flammarion, Paris, 1972.
- L'Homme et les hommes. Flammarion, Paris, 1976.
- Demain, les autres. Flammarion, Paris, 1979.
- Un jour, un homme... Flammarion, Paris, 1981.
- Le journal d'Harvey. Flammarion, Paris, 1983.
- La raison et la passion. Le Seuil, Paris, 1984.
- Le Dieu foudroyé. Flammarion, Paris, 1985.
-Le miel et la ciguë. Le Seuil, Paris, 1986.
- Monsieur Littré. Flammarion, Paris, 1988.
- La plus belle aventure du monde. Gallimard, Paris, 1988.
- Zouchy et quelques autres histoires. Flammarion, Paris, 1988.
- Dictionnaire promenade. Le Seuil, Paris, 1989.
- La puissance et la fragilité. Vingt ans après. Flammarion, Paris, 1990.
- Le livre de l'aventure humaine. Gallimard, Paris, 1990.
- Les belles imprudences, Réflexion sur la condition humaine. Odile Jacob, Paris, 1991.