Les débuts du programme génome en France

(du HLA à la cartographie du génome humain)

 

 

Il y a une soixantaine d'années, Francis Crick et Jim Watson décrivaient dans un célèbre article ('A Structure for Desoxyribose Nucleic Acid', Nature, 171, 1953) la structure en double hélice de l'ADN chromosomique et son rôle comme support de l'information génétique. Cet événement symbolise la révolution scientifique majeure du vingtième siècle : la rencontre de la biologie et de la chimie pour donner ce que l'on qualifiera désormais de biologie moléculaire. Dans son sillage, au cours des décennies suivantes, le développement des biotechnologies permettrait "...d'ouvrir la caisse à outils des sciences du vivant permettant aux biologistes de couper l'ADN et de le réinsérer ailleurs. Ainsi, la biologie est devenue explicative alors qu'elle restait jusque là essentiellement descriptive" dit Pierre Tabourin, le directeur du Génopole d'Evry. Désormais la génomique cherche à s'approprier la compréhension de l'organisation des génomes, tandis que les sciences de la vie - comme ses voisines les sciences de la matière - se prêtent aux multiples applications suscitées par les besoins de nos sociétés développées : le génie génétique pénètre dans l'industrie pharmaceutique pour supplanter la biochimie, on le met en oeuvre dans le secteur agro-alimentaire comme dans celui de l'energie, tandis que des chercheurs commencent à penser à des développements intéressant l'informatique. Au premier rang de ces applications figure évidemment la recherche médicale. Ainsi, au cours des années 1980, les Etats-Unis commencent à se préoccuper d'établir la séquence du génome humain. Leur Department of Energy (DoE) puis les National Institutes of Health (NIH) lancent le 'Human Genome Project'. En France, le Centre d'Etude du Polymorphisme Humain (CEPH) - créé par Jean Dausset, le découvreur du système d'histocompatibilité HLA, et son jeune confrère Daniel Cohen - s'allie à l'Association Française contre les Myopathies (AFM) pour entreprendre sa cartographie puis son séquençage. Il s'agit de développer le diagnostic des maladies génétiques, voire d'envisager - à terme tant cela semble utopique - la réalisation de thérapies géniques. De même, au tournant des années 1990 au Royaume Uni, le Medical Research Council (MRC) lance le 'Human Gene Mapping Project', au Japon le ministère de la recherche le sien et la Commission Européenne son propre programme (HUGO).  Parallèlement, l'étude du génome d'organismes modèles est soutenue. Le biologiste belge André Goffeau est chargé de coordonner le programme européen de séquençage de la levure (Saccaromyces cerevisiae), tandis que le biologiste anglais John Sulston séquence celui du ver C. elegans. D'autres modèles (drosophile, souris, ...) ne tarderont pas à suivre.
C'est pour évoquer le genèse de cette extraordinaire entreprise scientifique démarrée il a un quart de siècle - comme de ses conséquences économiques, sociales, voire éthiques - qu'une convention de recherche fut établie en 2001 en vue de réunir les premiers éléments d'une histoire de la génomique en France. Ce programme est relancé aujourd'hui dans le cadre d'une nouvelle convention de recherche passée entre le Génopole d'Evry , l'AFM et le CNRS (Histoire du Programme Génome), inscrite dans la perspective d'un projet international lancé à l'occasion du dixième anniversaire du séquençage du génome humain.

Repères chronologiques avec liens vers des publications électroniques

1962
  • Prix Nobel de F. Crick, J. Watson et M. Wilkins pour la découverte du rôle de la structure en double hélice de l'ADN dans les mécanismes de l'hérédité
  • 1975
  • Renato Dulbecco (Nobel 1975 avec D. Baltimore et H. M. Temin) lance l'idée de localiser les gènes responsables du cancer du sein
  • Mise au point progressive des premières méthodes de séquençage (A. Maxam & W. Gilbert, Fred Sanger ...)
  • 1977
  • Jean Dausset est nommé à la chaire de médecine expérimentale au Collège de France
  • 1978
  • Raymond White et J. M. Lalouel lancent l'idée du balisage des points polymorphes du génome
  • 1979
  • Daniel Cohen intègre l'équipe de Jean Dausset au sein l’UR Inserm 93 "Immunogénétique de la transplantation humaine" à l'hôpital Saint-Louis
  • 1980
  • Nobel de J. Dausset, B. Benacerraf et G. D. Snell pour l'identification du système immunitaire 'Human Leucocyte Antigene' (HLA)
  • Congrès d'Oxford sur l'analyse génétique du HLA
  • Première rencontre de Daniel Cohen avec Ray White et Jean-Marc Lalouel
  • 1981
  • Legs H. Anavi à J. Dausset
  • Année sabbatique de Howard Cann chez Dausset, à la recherche de la variabilité de HLA dans l'ADN
  • 4 nov : Association Française contre les Myopathies (AFM) (créée en 1958) se dote d’un conseil scientifique (Jean Demos, J. -C. Dreyfus, Michel Fardeau, François Leterrier, Georges Schapira, pr. Serratrice,...) afin de définir les grandes orientations qu'elle compte donner à la recherche fondamentale et à la recherche clinique
  • 1983
  • Workshop sur le polymorphisme de l'ADN à Miami sur l'intérêt de dresser la carte du génome humain. Décision de créer un Centre d'étude du Polymorphisme humain (CEPH) à Paris.
  • Fév. : Bourse AFM accordée à J.- C. Kaplan (Hop. Cochin) pour le développement du diagnostic prénatal (mise au point de sondes génétiques, banques d’ADN...). Michel Fardeau " évoque les immenses espoirs du génie génétique"
  • 1984
  • 20 octobre : Première réunion du CEPH à la fondation Hugot (J. Dausset, D. Cohen, H. Cann, J.-M. Lallouel, Ray White, D. Botstein, J-L Mandel, ...)
  • 1985
  • Réunion génome humain à l'U. de Santa Cruz (R. Sinsheimer, L. Hood)
  • Sept. : Note de Jean-Claude Kaplan et J.-L. Mandel au Conseil scientifique de l'AFM signalant la découverte d’une sonde permettant le diagnostique de la myopathie de Duchenne, "... un progrès considérable, mais qui risque d'entrainer un afflux massif de demandes de diagnostic de la part des familles à risque".
  • 1986
  • Maynard Olson initie Daniel Cohen à la technique des Yeast Artificial Chromosomes (mise au point des megaYACs)
  • Annonce de l'identification du gène de la myopathie par Anthony Monaco lors du contrès de Tours organisé par l'AFM
  • André Goffeau lance le programme européen de séquençage de la levure (Bruxelles DG XII)
  • 1987
  • Premier Téléthon organisé par l'AFM
  • 1988
  • 12 janv. : François Gros informe le Conseil scientifique de l'AFM du projet de Jean Weissenbach concernant la cartographie des maladies génétiques localisées dans la partie terminale du bras court du chromosome X
  • Mars : Première rencontre de Daniel Cohen et de Bernard Barataud
  • 27 - 28 avril : Bernard Barataud annonce l'accord passé entre l'AFM et le CEPH en vue d'y installer un service de service de production de sondes et la fourniture par la société Bertin "...d’automates destinés à la biologie moléculaire"
  • Lancement d'un appel d'offre 'Génomes' par le ministère de la recherche (Jacques Hanoune, Michel Cohen Solal)
  • 1989
  • Inauguration (officielle) du CEPH par le pdt. F. Mitterrand. Mise en service des premiers robots conçus par Bertin
  • Jean Weissenbach passe une année sabbatique au CEPH
  • Premiers essais de thérapie génique aux Etats Unis sur des cancéreux en phase terminale (S. Rosenbert, M. Blaese, F. Anderson)
  • Octobre : premier colloque international sur le génome à San Diego (Calif.) suivi du lancement du Human Genome Project aux Etats-Unis par le Dept. of Energy sous la direction de Jim Watson
  • 1990
  • 7 avril : Le Conseil scientifique de l'AFM décide de créer Généthon
  • 8 décembre à Evry : Inauguration du Généthon par Hubert Curien, Ministre de la Recherche et de la Technologie, destiné à accueillir l'équipe de Daniel Cohen, celle de Jean Weissenbach et le programme de séquençage 'Genexpress' de Charles Auffray
  • 1991
  • Congrès 'Human Gene Map' à Londres (les NIH refusent de financer le CEPH dit DC)
  • Lancement du GIP 'Génome' , devenu 'Groupement de recherche pour l'étude des génomes' (GREG) sous la direction de Piotr Slonimski
  • 4 décembre : interview de Barataud par Télérama : "un pays n'a pas le droit d'abandonner ses gosses mal foutus..."
  • 1992
  • 18 septembre : Première carte physique couvrant 40 % du génome humain
  • 2 octobre : Première carte physique du chromosome 21 humain. Article de Cell : "Mapping the whole human genome by fingerprints yeast artificial chromosomes"
  • 29 octobre : Carte génétique comportant 813 marqueurs microsatellites
  • Charles Auffray (CNRS) dépose 2000 séquences de gènes à l'Unesco
  • 1993
  • Février : l'équipe d'Axel Kahn (Hop. Cochin) corrige la déficience de dystrophine chez la souris
  • 4 oct : Ouverture du Sanger Institute à Cambridge
  • 15 décembre : la publication de la première carte physique du génome (CEPH-Généthon) provoque une polémique dans la revue 'Science'
  • Isolement des gènes déficients de la chorée de Huntington aux Etats-Unis
  • Début de la collaboration de D. Cohen avec Millenium (Eric Leander)
  • Pierre Tambourin est nommé directeur du département des sciences de la vie au CNRS
  • 1994
  • 6 juin : Publication d'une nouvelle carte génétique comportant 2066 micro-satellites évoquée dans un numéro spécial de Science
  • 1995
  • Lancement de Généthon 2 et du programme TGS (Très Grand Séquençage) avec Genset
  • 1er janvier : Création au sein de Généthon du laboratoire de maladies génétiques humaines, dirigé par Jean Weissenbach (URA CNRS 1922)
  • 28 septembre : Publication d'une carte intégrée physique et génétique de 2ème génération, réalisée par les chercheurs de la Fondation Jean Dausset-CEPH en collaboration avec l'équipe de Généthon
  • 1996
  • Installation de Genset au Génopole d'Evry
  • Séquençage intégral du génome de la levure
  • 1997
  • 1er janvier : Création de Genoscope - Centre National de Séquençage (CNS) par Jean Weissenbach
  • 31 décembre : Création du Centre National de Génotypage (CNG) avec Mark Lathrop.
  • Publication du premier génome eucaryote intégralement séquencé, celui  de la levure
  • 1998
  • 20 janvier : Lancement de la mission Genopole par C. Allègre, Ministre de l'Éducation Nationale, de la Recherche et de la Technologie
  • 6 juillet : Création de l'Association Genopole
  • 22 octobre : Installation de Neurotech dans l'incubateur d'entreprise CCIE - Genopole Industries
  • 23 octobre : Lancement du GIP Genopole en présence des Ministres Claude Allègre et Dominique Strauss-Kahn. Pierre Tambourin est nommé directeur général
  • 1999
  • Lancement de Généthon 3, laboratoire de l'AFM qui se consacre à la mise au point et à la production de vecteurs pour la thérapie génique
  • .../...

     

    Voir en outre les dossiers consacrés à :

    André Adoutte (CNRS CGM)
    Ségolène Aymé (Orphanet)
    Bernard Barataud (AFM)
    André Boué (Inserm)
    René Cadoret (AFM)
    Michel Callon (CSI, Ecole des Mines)
    Daniel Cohen (Genset)
    Jean Dausset (CEPH) 
    Jacques Demaille (DSDV CNRS)
    Dominique Duguet (AFM)
    Michel Fardeau (I. de myologie, Pitié Salpêt.)
    Alain Fischer (CHU Necker) 
    Jean Frézal (Genatlas)
    André Goffeau (U. C. Louvain)
    Claude Griscelli (CHU Necker)
    François Gros (I. Pasteur)
    Jacques Hanoune (CHU Henri Mondor)
    François Jacob (I. Pasteur)

    Bertrand Jordan (CIML)
    Axel Kahn (ICBM, U. Paris V)
    Jean-Claude Kaplan (CHU Cochin)
    Philippe Kourilsky (I.P. Paris)
    François Leterrier (AFM)
    Bernard Malissen (CIML)
    Robert Manaranche (AFM)
    Jean-Louis Mandel (IGBMC, Strasbourg)
    Eric Molinié (AFM)
    Jean-Claude Mounolou (CNRS CGM)
    Arnold Munnich (CHU Necker) 
    Jean Rosa (CHU H. Mondor, Inserm)
    Piotr Slonimski (GREG)
    Pierre Tambourin (Génopole d'Evry) 
    Pierre Tiollais (I. Pasteur)
    Bruno Tocqué (ExonHit)
    Jean Weissenbach (CNS)



    Eléments de bibliographie

    Académie Nationale de Médecine, "Génomique et Médecine", Extrait du bull. de l'ANM, 2000, n° 7, séance du 10 oct. 2000. Paris, I. Theramex, 2000
    Bernard, Jean, Dausset, Jean, (avec la collaboration de Antoine Hess), "La mosaïque humaine. Entretiens sur les révolutions de la médecine et le devenir de l'homme", Paris, Calmann - Lévy, 2000 (CERMES B 211)
    Branciard, Anne, "Politiques publiques et espace d'innovation dans la biologie. Etude de dispositifs d'intégration science/industrie et de création d'entreprises : le cas de la Génopole d'Evry", LEST, UMR 6123,  Génopole d'Evry,  juillet 2002
    Callon, Michel et Rabeharisoa, Vololona, "Le Pouvoir des malades. L'association française contre les myopathies et la recherche", Paris, Presses de l'École des mines, "Sciences économiques et sociales", 1999
    Cohen, Daniel, "Les gènes de l'espoir. A la découverte du génome humain", préf. de Jean Dausset, Paris, Laffont, 1993
    Cook - Deegan, Robert, "The Gene Wars. Science, politics and the human genome", New York, Norton & Cy, 1994 (CERMES C 131)
    Dausset, Jean, "Clin d'œil à la vie. La grande aventure HLA". Paris, Odile Jacob, 1998
    Goujon, Philippe, "From Biotechnology to Genomes, the Meaning of the double Helix", Singapour, World Publishing Press, 2001 (cote CERMES, C 402)
    Gaudillière, Jean-Paul & Rheinberger, Hans-Jörg (Eds.) "
    From Molecular Genetics to Genomics. The mapping cultures of twentieth century genetics", Atlanta, Routledge, 2004 (CERMES G 285)
    Jordan, Bertrand, "Voyage autour du génome", Paris, Inserm - John Libbey Eurotext, 1993 (CERMES J 13)
    Kevles, Daniel & Hood, Leroy,
    "The Code of Codes, Scientific and social issues in the Human Genome Project", Cambridge, Harvard U. Press. 1992 (CERMES K 37)
    Mattei, Jean-François (Ed.),
    "Le génome humain", Coll. 'Regard éthique', Strasbourg, Editions du Conseil de l'Europe, 2001 (CERMES M 164)
    Nelkin, Dorothy, Lindee, M. S.
    , "The DNA Mystique, the gene as a cultural icon", New York, Freeman, 1995 (CERMES N 36)
    Peerbaye, Ashveen,
    "La construction de l'espace génomique en France : la place des dispositifs instrumentaux", Thèse ENS, 2004
    Rabinow, Paul
    , "French DNA. Trouble in Purgatory", U. of Chicago Press, Chicago and London, 1999
    Ridley, Matt, "Genome. The autobiography of a species in 23 chapters", New York, Harper Collins, 2000 (CERMES R 114)
    Watson, James D., 'The Double Helix. A personal account of the discovery of the structure of DNA', London, Penguin, 1968

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